Актуальность. Совершенствование диагностики и оказания пародонтологической помощи пациентам с хроническим пародонтитом в сочетании с герпетическими и кандидозными поражениями является актуальной целью многих современных исследований. Пандемия COVID-19 и постковидный синдром достаточно существенно изменили взгляд врачей-стоматологов на диагностику и лечение указанных коморбидных и ассоциативных заболеваний. Цель: сравнение индекса биоразнообразия Шеннона исследуемых групп. Материалы и методы. Нами было проведено одноцентровое рандомизированное проспективное клинико-микробиологическое контролируемое открытое исследование в целях определения коморбидности герпеса и ассоциации кандидоза и хронического генерализованного пародонтита, обследован 61 пациент (в возрасте от 18 до 19 лет). Результаты. В целом, хочется подчеркнуть, что чем меньше мы фиксируем индекс биоразнообразия Шеннона, тем более здоровым является исследуемое пространство, в нашем случае пародонтальное, так как меньшее биоразнообразие — это сформированное устойчивое микробное сообщество, способствующее сохранению постоянства и защите от условно-патогенных и патогенных форм. В заключение необходимо отметить, что патогенез COVID-19 поистине интересен и уникален, а данных об изменении спектра пародонтопатогенной и нормальной микробиоты при рассматриваемой патологии практически нет, поэтому применение метагеномного анализа орального микробиома на фоне перенесенной коронавирусной инфекции расширит представления о течении указанных коморбидных заболеваний. Лечебные мероприятия с целью снижения вирусной нагрузки в тканях пародонта могут способствовать не только снижению количества возможных ниш для жизнедеятельности вируса, но и укреплению тканей пародонта, препятствуя развитию коморбидных и ассоциативных форм заболеваний.