Актуальность темы исследования. Состав наддесневого и поддесневого зубного налета, десневой и ротовой жидкости, зубодесневого или пародонтального кармана является ценной диагностической средой при проведении неинвазивной диагностики воспалительных заболеваний пародонта, поскольку содержит большое разнообразие микроорганизмов, многие из которых являются маркерами. Цель — неинвазивная оценка маркеров развития заболеваний пародонта на основании изучения микробного состава различных биотопов полости рта методом ПЦР. Материал и методы. Неинвазивная диагностика факторов риска, в частности, наличия пародонтопатогенной микрофлоры предусматривала исследование различных биотопов полости рта: зубного налета, ротовой и десневой жидкости, состава зубодесневого кармана путем применения качественного метода ПЦР-диагностики с использованием коммерческих наборов ДНК-экспресс (ООО НПФ «Литех», Россия). Результаты исследования. Сравнительное изучение маркеров развития заболеваний пародонта с использованием качественного варианта тест-системы ПЦР в пробах поддесневого зубного налета и содержимом зубодесневого кармана лиц с начальным пародонтитом стадии I показало в 3,1 раза большую распространенность представителя желтого комплекса Aggregatibacter actinomycetemcomitans, в 1,4 раза большую — представителя красного комплекса P. gingivalis. В исследуемом материале наддесневого зубного налета, десневой и ротовой жидкости лиц с гингивитом, индуцированным микробной биопленкой, в 2,6 раза чаще превалирует представитель желтого комплекса Aggregatibacter actinomycetemcomitans, соответственно в 2,1 и 1,4 раза чаще представители красного комплекса — P. gingivalis и Tannerella forsythia, в 1,4 раза оранжевый комплекс Fusobacterium nucleatum. В пробах наддесневого зубного налета, десневой жидкости у лиц с клинически здоровой десной при убыли тканей пародонта доминируют представители микрофлоры, формирующие оранжевый, красный и желтый комплексы. Выводы. Исследование наддесневого и поддесневого зубного налета, десневой и ротовой жидкости, зубодесневого кармана с использованием тест-системы ПЦР позволяет своевременно выявить маркеры развития воспалительных заболеваний независимо от клинического состояния пародонта.